宗室海丰君李耆等闻国王欲走，率数十百人叩阁痛哭。李睑对大臣们说：“身为国王，肯定要跟卿等同生共死，我绝不会走的！”将这群人忽悠走之后，李昖立马就传令准备走人。半夜里国王李昖骑马、世子李珲乘屋轿悄悄而出，尹斗寿、柳成龙等护驾，甚至连宫内宫人都没遗漏，一律带走。此外国王也命令余下诸位皇子分头奔赴各道：临海君和漆溪君赴咸镜道，顺和君和长溪君赴江原道，招兵勤王。
国王一走，本就不稳的王京霎时便乱了起来，早就对昏庸国王不满的朝鲜百姓听闻国王逃跑，怒不可遏，放火焚烧了藏有公私奴婢文籍的掌隶院刑曹，又入内帑库抢掠金帛，再烧景福宫、昌德宫、昌庆宫。历代珍宝古玩，文武楼、弘文馆所藏书籍，春秋馆各朝实录以及其库藏前朝史稿、承政院日记等等皆化为灰烬。李昖一行就这样一路狼狈逃窜，开始抵达松都开城，六天后又马不停蹄地抵达平壤。
小西行长一战击灭申砬所部后，加藤清正也抵达了忠州地区，与小西行长会合。小西行长一路斩获极多，加藤清正心中很是不满。双方在忠州城商议进军事宜之际，加藤清正故意挑衅，让小西行长攻击汉城的医馆区，完全就是嘲讽小西行长以前是个卖草药的。结果两人渐起口角，以至双方拔刀相向。最终此二人还是分道扬镳，他们晚上也不休息，命令士兵尽快开拔，希望早日杀入汉城，争得头功。
到了五月，日军前锋来到了汉城对面的汉江南岸，不断威胁要渡河。本已极为脆弱的朝鲜军见到日本人之后完全崩溃，江防诸将命左右速上马鞍，不战而溃。都元帅金命元吓得沉军器火炮于江中，与副元帅申恪等各自逃窜。留守王京的都检察使李阳元等也弃城而走，首都霎时间便成了一座空城。
五月初二，日军杀至王京汉城兴仁门外，只见城门大开，居然无士卒把守。日本人还以为朝鲜人玩空城计，愣是不敢进去。磨蹭了很久，发现城内没啥动静，才派遣几十个人先去探路，这才确认王京汉城真的被放弃了。
日军四月十三日在釜山登陆，到五月初二便攻陷了汉城，前后不过二十天，居然就打下了朝鲜的半壁江山，用势如破竹来形容实在不为过，如果再得不到有力的援助的话，那么朝鲜灭亡便近在眼前了。
居然如此轻易地攻下了朝鲜的首都，这让丰臣秀吉大喜过望，他立时便觉得世界尽在掌握之中，于是拟定了一个《丰大阁三国处置大早计》二十五条致丰臣秀次，要恭请天皇于后年移都北京，“呈献都城附近十国与皇室，诸公卿亦将予采邑；大唐（明）国之关白让与丰臣秀次，日本之关白则从大和中纳言、备前宰相二人中择一委任；日本天皇拟由后阳成天皇之子良仁亲王或皇弟八条出任；高丽（朝鲜）国由岐曾宰相或备前宰相统治”，等等。又在同曰拟《山中橘内之尺牍》称：“天皇居北京，秀吉本人由海路移驻浙江宁波”。
小西行长抢先占领了汉城，加藤清正很是不满，在王京没待多久就领兵北上，很快便开到临津江南岸，与朝鲜军隔江对峙。朝鲜军早已将两岸船只尽数收罗，置于江北。加藤清正无船可渡，只能面对宽阔的江面，长吁短叹，无可奈何。
双方相持了十余日后，加藤清正想了一个办法，将江边临时搭建的军营全部烧毁，让士兵们收拾东西，作出一副要撤军的样子。防守北岸的朝鲜防御使申硈以为日军要逃，居然渡河追杀。
没了大河的阻隔，这些朝鲜军面对日军可谓是一触即溃，一顿铁炮就被逼到了江边，最终不是被水溺死就是被杀掉。北岸守军见南岸朝鲜军被屠杀的惨状，心惊胆战。有一个叫朴忠侃的官员见此情景，吓得拨马便走，众军士一哄而散，临津江防线就以这样的方式被日军突破。
五月二十七日，加藤清正、小西行长攻入开城。
六月一日，日军诸部以拈阄方式定所向，以小西行长向平壤推进，加藤清正向咸镜道进军，而黑田长政向黄海道开进。