当当的鸣金声阻止了明军跟在小西行长身后衔尾追杀，看着明军重归整齐的队列，吴惟忠道：“平壤自有李提督攻取，我等任务是将此牡丹台一举荡平。传令下去，全军扎下营寨，将牡丹峰团团围死，再派一小队人马上去探探虚实。”
此时一队朝鲜僧兵拥到了吴惟忠的面前，为首的休静和尚向吴惟忠大声道：“天兵打头阵，吾等僧众愿为之摇旗呐喊，以壮声势！”于是在试探的明军身后，跟随了大批僧兵，远远看去气势倒是不弱。
黑压压的人群让日军以为明军开始了大举的进攻，因此在守将小西末乡、浦原次郎等人的指挥下，火绳枪一排排地从高向下发射，硝烟瞬间弥漫了整个牡丹台。见牡丹台地势险要，日军防御完善，火器凶猛，明军于是直接扔了几十面盾牌向下撤退，而朝鲜僧兵在撤退之时更是显得不堪。
驻守牡丹台的日军以为明军被击败了，居然打开了城门企图尾追明军捡便宜。他们哪里知道明军大部队就在后面等待时机，刚追了没多久就发现数百杆火铳的枪口正对着他们。随着一声“开火”，阵地上立时响起了一阵急速的枪声，日军的阵形如被重重地打了一拳般凹陷了进去。硝烟过后，只听满地日军伤卒的呻吟。此次的逆袭明军斩首三十余级，曰军被打得只能再次闭门死守。
吴惟忠在牡丹峰下鏖战之际，朝鲜兵使李镒、防御使金应瑞等人亦率领朝鲜兵马随着祖承训来到了平壤城南。看着飘扬着曰军军旗的平壤城墙，李镒等朝鲜军将脸上均显出一抹愧色。逃跑将军李镒拔出长剑大叫道：“这是我朝鲜人的都城，也该由朝鲜人夺回！”说罢就要挥军进攻。
此时身边诸将劝阻道：“天朝李提督曾有明言，各军需统一号令，一齐攻城，如今提督尚未下令，我军私自攻城甚为不妥。”
李镒怒道：“我朝鲜之地，何须他人做主！”于是朝鲜军还未等明军发动便开始了攻城行动。
祖承训等明将此时亦在阵中，李宁看到朝鲜军不听号令便开始攻城，便问祖承训：“朝鲜兵胆敢违抗提督号令私自行事，我等岂能坐视？”
祖承训向李宁微一拱手，嘿嘿冷笑道：“李副将，此乃朝鲜地方，你我均为客军，自然是客随主便，太过迫切反而不美，君不见我这被一撸到底的前车之鉴么？这平壤城倭贼兵盛、鸟铳犀利，我等还是约束好部众，待会儿必有一场好戏要看！”
此时宗义智已经接回小西行长，听说朝鲜军于城南攻城，立刻率兵马增援。他看到朝鲜兵的攻击杂乱无章，不由得嘲笑道：“朝鲜兵马如此孱弱，居然还敢来送死！”于是趁着天色已晚，悄悄地开了城门反杀出去。朝鲜军没料到日军居然如此大胆，片刻就被打得溃不成军，之前在曰军面前惨败的恐惧霎时间又回到了身上，不由得纷纷狼狈奔逃。
将城南朝鲜军攻城部队击溃之后，宗义智马不停蹄地回到城西进行了又一次的调动。几个时辰过去，大地重归宁静，平壤城头上却无声无息地垂下了一条条黑影，向明军营寨掩杀而去。这次行动其实是宗义智重施故技，派遣三千重兵向明军进行夜袭。这次的夜袭换了个地方，从平壤西面出击，急袭杨元、李如柏和张世爵三将的营寨。
入夜的平壤城外一片寂静，只有北风吹过的呼啸声在旷野回响。黑暗中日军顺利地掩近了明军营寨，只见几个投入日军的朝鲜士兵手持长弓，向营寨内放哨的明军开始了射击。
“啊！”一声惨呼回荡在明军的营寨，一个明军哨兵凑巧躲过了要害，他忍着肩上中箭的剧痛，拼命敲响了警钟：“有敌袭！”
这夜明军上下早有明令，人不卸甲马不卸鞍，听到报警，明军纷纷抓起了兵器冲出了帐篷，在各级兵长的指挥下列阵。而日军眼见夜袭败露，便有几个人飞身而出，拼命搬开明军大营外的鹿砦，后面大部队发一声喊，挥舞着倭刀直杀而入。